En el año de 1781, en el departamento de Santander se inician una serie de revueltas, la razón: el Rey de España, Carlos III, había designado como regente de la real audiencia de Santafé de Bogotá a Juan Francisco Gutiérrez de Piñeres para hacer cumplir las Reformas Borbónicas en la Nueva Granada. Estas traerían consigo una serie de medidas económicas y administrativas que no agradarían a la sociedad en general y dentro de las que se encontraban el alza a los impuestos al aguardiente y al tabaco.

Este hecho causó un gran malestar entre los criollos de todas las clases sociales. Es así como Manuela Beltrán arrancaría el edicto de la corona que comunicaba al pueblo la decisión sobre el aumento en los impuestos. Asi pues, se reconoce a Juan Francisco Berbeo y unos capitanes como líderes del movimiento y se organizaron en la Junta Comunera, lo que a la postre daría origen al movimiento comunero. La gente del común, en una revuelta, partiría hacia Santafé de Bogotá con 4000 hombres, con la misión de tomarse la capital de la república. En el camino lograron acumular un ejército de 20000 tropas lo que puso en alerta a la Virreinato de la Nueva Granada.

Con el fin de impedir la avanzada de las tropas comuneras, la corona delegaría a el Oidor Vasco y Vargas, el alcalde de Zipaquirá Eustaquio Galvis y al Arzobispo Antonio Caballero y Góngora para negociar desde esta ciudad. Así pues, los comuneros acamparían en Nemocón mientras sus los capitanes, en cabeza de Berbeo, negociaron con la corona las 34 capitulaciones, todas fueron aceptadas por los negociadores españoles y luego serían incumplidas por el virreinato.

El príncipe de Bogotá (actual municipio de Funza), Ambrosio Pisco, oriundo de Bogotá (hoy Funza), indígena prominente que venía de Güespa Santander, acompañado por más de 5000 indígenas, escucharían la misa campal ofrecida por Caballero y Góngora en la que se comprometía a cumplir los acuerdos contenidos en las capitulaciones.

Al ser incumplidos los acuerdos contenidos en las capitulaciones negociadas con Berbeo y sus capitanes, dentro de las que se incluían devolver las minas a los indígenas como se había acordado en 1779, en Nemocón se inició otra revuelta. Así fue, que, en cabeza de Ambrosio Pisco, los indígenas de Nemocón iniciaron una revuelta: apresaron a los tres regidores del pueblo, quemaron la casa del alcalde, la casa del cabildo, la casa del administrador de la mina y tomaron posesión de las salinas que les pertenecían desde tiempos milenarios.

Un aviso desde Nemocón alertaría a Santafé de lo que estaba ocurriendo en el pueblo. Fue entonces el momento en el que encomendarían, al recién llegado de Cartagena coronel José Bernet, con 200 hombres a su disposición, bien armados y entrenados, a apaciguar los levantamientos indígenas y así recuperar las salinas.

Fue así qué, el 1 de agosto de 1781, llegaron las tropas reales comandadas por Bernet a Nemocón y con ellos la pesadilla de la masacre. Incendiaron varias casas, y atacaron a la población sin distinción de niños, hombres, ancianos o mujeres. El pueblo quedo desolado y destrozado, 20 indígenas fueron heridos y a 4 se les causó la muerte, otros fueron enviados presos a Cartagena, entre ellos Ambrosio Pisco. Para contrarrestar cualquier levantamiento en Santafé, Brenet ordenó decapitar a los muertos y clavar sus cabezas en picas a las entradas de la ciudad, exponiéndolas como escarmiento para intimidar a la población y demostrar lo que pasaba a los insurrectos.